RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GUV1 79 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF575Q86XF7 245 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 Q8NAQ8 132 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 COX7BP24311 80 aa6.98□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 MTORP42345 2549 aa6.98□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 MUC4Q99102 2169 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 JMJD1CQ15652 2540 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 H3BT86 120 aa6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 HAMPP81172 84 aa6.96□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 COX17Q14061 63 aa6.96□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 hADV29S1A0JD25 119 aa6.96□□□□□ -1.29
TTPAL-202ENST00000372904 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 C14orf177Q52M58 125 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 UBL5Q9BZL1 73 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.96□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV2D-28P01615 120 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 C6orf99Q4VX62 202 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.95□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 UBE2AP49459 152 aa6.94□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.94□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 ESRGQ1W209 222 aa6.94□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.94□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 LY6G6CO95867 125 aa6.93□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 NUPR2A6NF83 97 aa6.92□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 LST1O00453 97 aa6.92□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 ACYP1P07311 99 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 TRACP01848 142 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 RELNP78509 3460 aa6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L23D6RBM5 183 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 ITPR3Q14573 2671 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 M0R378 163 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 CDK2AP2O75956 126 aa6.9□□□□□ -1.3
TTPAL-202ENST00000372904 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.9□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.9□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 CENPEQ02224 2701 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087WYN8 130 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.89□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.88□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 H3BQ85 93 aa6.88□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZRU5 148 aa6.88□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.88□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.88□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.87□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 K7EIL1 84 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 H3BNG1 76 aa6.86□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 COL12A1Q99715 3063 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 BSNQ9UPA5 3926 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 ENHOQ6UWT2 76 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZQY7 126 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 B9D2Q9BPU9 175 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 MT-ATP8P03928 68 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.85□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.84□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 C10orf25Q5T742 122 aa6.84□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.84□□□□□ -1.31
TTPAL-202ENST00000372904 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 MUC7Q8TAX7 377 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 KALRNO60229 2985 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 F8P00451 2351 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 C2orf48Q96LS8 159 aa6.83□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 MDFIQ99750 246 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 NREPQ16612 68 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N814 137 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 M0QXV9 152 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 LITAFQ99732 161 aa6.82□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 A0A096LNI7 61 aa6.82□□□□□ -1.32
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