RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 C1orf54Q8WWF1 131 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP3R2Q96LZ3 170 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 AQP10Q96PS8 301 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SCN3BQ9NY72 215 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 R4GMQ9 66 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ARAP2Q8WZ64 1704 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 LAMC1P11047 1609 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 CUL7Q14999 1698 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 EFCAB10A6NFE3 127 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 C10orf142B7Z368 130 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ZZEF1O43149 2961 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 APOC2P02655 101 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 AKAIN1P0CW23 69 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 CATR1Q13166 79 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ANK2Q01484 3957 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PKD1P98161 4303 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TCHHQ07283 1943 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MBD5Q9P267 1494 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC7Q96NW7 1537 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LYSTQ99698 3801 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF831Q5JPB2 1677 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 KDM3BQ7LBC6 1761 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A1B0GV90 55 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 BCE1O60756 84 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 IFNGP01579 166 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 PP6455Q8WZ26 134 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TSLPQ969D9 159 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CNFNQ9BYD5 112 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LENEPQ9Y5L5 61 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 AKAP9Q99996 3911 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 NAIPQ13075 1403 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DMDP11532 3685 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MUC17Q685J3 4493 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TULP4Q9NRJ4 1543 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 AKAP6Q13023 2319 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 UGGT1Q9NYU2 1555 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA0556O60303 1618 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 WIZO95785 1651 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 COL4A6Q14031 1691 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 IGLC7A0M8Q6 106 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 OOSP1A8MZH6 123 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 F8VRH5 84 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DLEU1O43261 78 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SSSCA1O60232 199 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ASIPP42127 132 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 HAMPP81172 84 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 COMMD6Q7Z4G1 85 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 C5orf38Q86SI9 138 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 BAGE2Q86Y30 109 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MGST2Q99735 147 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 DYNLRB1Q9NP97 96 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 PRO0255Q9UI72 69 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 V9GYH0 126 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MRC1P22897 1456 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 PEG3Q9GZU2 1588 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 USP32Q8NFA0 1604 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA3Q99758 1704 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TSC2P49815 1807 aa0.01□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CORTO00230 105 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 HMGN4O00479 90 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 UQCR11O14957 56 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 SNAPC5O75971 98 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ADGRL2O95490 1459 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TNFP01375 233 aa0□□□□□ -2.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CUX1P39880 1505 aa0□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms