RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYOM2P54296 1465 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC11AP67812 179 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 C12orf57Q99622 126 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 SVBPQ8N300 66 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JMZ2 1700 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCHHQ07283 1943 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNG4P50150 75 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAT1Q14517 4588 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFCAB10A6NFE3 127 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BQ15 152 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMA5O15230 3695 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 CORTO00230 105 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLEU1O43261 78 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP3R1P63098 170 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRIPTQ9P021 101 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCN7AQ01118 1682 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUL7Q14999 1698 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GU69 56 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GV90 55 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRR2EP22531 72 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTDAPP60985 99 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 NALCNQ8IZF0 1738 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 FMN2Q9NZ56 1722 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 CGREF1Q99674 301 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOP2BQ02880 1626 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WVE0 104 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 I3L3M4 83 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNCAP37840 140 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBASA2RRP1 2371 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 C7orf77A4D0Y5 90 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM262E9PQX1 116 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BQF6 201 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 S100A1P23297 94 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 REV3LO60673 3130 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 PZPP20742 1482 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JND7 137 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 hADV29S1A0JD25 119 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0Y9P7 68 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSD52Q0P140 79 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNG8Q9UK08 70 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM203Q969S6 136 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL4A6Q14031 1691 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKD1P98161 4303 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNGT1P63211 74 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLIT1O75093 1534 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL22O00626 93 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFC1O43677 76 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKAP13Q12802 2813 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 TACC2O95359 2948 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCC5O15440 1437 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms