RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362813.1

RN7SKP185-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 185, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP185, Length 326 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP185-201ENST00000362813 DAD1P61803 113 aa3.85□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 LELP1Q5T871 98 aa3.85□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.85□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.85□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 FLNCQ14315 2725 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 A0A0J9YWU9 116 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 J3QKU1 62 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 Q8NAQ8 132 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 PRR34Q9NV39 138 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 LINC00846Q9NV44 126 aa3.84□□□□□ -1.79
RN7SKP185-201ENST00000362813 SPG11Q96JI7 2443 aa3.84□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 ZFHX3Q15911 3703 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 NCR3O14931 201 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 WIPF1O43516 503 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 CRYGAP11844 174 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SPAG11BQ08648 103 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 DEFB135Q30KP9 77 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 LINC00575Q6W349 94 aa3.83□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 A0A096LPF7 62 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 H3BNG1 76 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 GHRHP01286 108 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 IGLV6-57P01721 117 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SLPIP03973 132 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 C6orf99Q4VX62 202 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 C6orf223Q8N319 242 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 C2orf48Q96LS8 159 aa3.82□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 USP24Q9UPU5 2620 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 CREBBPQ92793 2442 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 BCE1O60756 84 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 PDE6GP18545 87 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SERP2Q8N6R1 65 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 CELA1Q9UNI1 258 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.81□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 hADV29S1A0JD25 119 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 F8WDY8 70 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 Q8NDZ9 215 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 UBL5Q9BZL1 73 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 ITPR3Q14573 2671 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 ZANQ9Y493 2812 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.8□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 COL12A1Q99715 3063 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 VPS13CQ709C8 3753 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 USP17L23D6RBM5 183 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 DEFB4AO15263 64 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 TMEM258P61165 79 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 C10orf25Q5T742 122 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 ENHOQ6UWT2 76 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 Q6ZQT0 140 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 Q8N3U1 123 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 DIRC1Q969H9 104 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 ACACBO00763 2458 aa3.79□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 SMR3AQ99954 134 aa3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 UPK3BQ9BT76 320 aa3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 KLK12Q9UKR0 248 aa3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 POLQO75417 2590 aa3.78□□□□□ -1.8
RN7SKP185-201ENST00000362813 APCP25054 2843 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 CHD6Q8TD26 2715 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 PTPN13Q12923 2485 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 A0A087WVE0 104 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 J3KT08 172 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 HTN3P15516 51 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 COX7BP24311 80 aa3.77□□□□□ -1.81
RN7SKP185-201ENST00000362813 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms