RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf134Q5TEV5 83 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB116Q30KQ4 102 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 COX7CP15954 63 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 LYPD5Q6UWN5 251 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00208Q96KT6 92 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00310P59036 64 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WVE0 104 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 Q6Q795 121 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 A8MTW9 85 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf142B7Z368 130 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 PCOTHQ58A44 107 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 AMELXQ99217 191 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 EML5Q05BV3 1969 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRM-201ENST00000332175 SPINK1P00995 79 aa15.84■□□□□ 0.13
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PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZRU5 148 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WSZ3 146 aa15.82■□□□□ 0.12
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PTPRM-201ENST00000332175 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.82■□□□□ 0.12
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PTPRM-201ENST00000332175 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A096LNJ9 63 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRM-201ENST00000332175 CACNA1AO00555 2505 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRM-201ENST00000332175 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRM-201ENST00000332175 H0Y9P7 68 aa15.71■□□□□ 0.1
PTPRM-201ENST00000332175 C22orf24Q9Y442 160 aa15.71■□□□□ 0.1
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PTPRM-201ENST00000332175 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.7■□□□□ 0.1
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PTPRM-201ENST00000332175 SMCR5Q8TEV8 140 aa15.68■□□□□ 0.1
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PTPRM-201ENST00000332175 HCG22E2RYF7 251 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRM-201ENST00000332175 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-201ENST00000332175 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM26A0A096LP01 95 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRM-201ENST00000332175 AGRNO00468 2067 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00337Q8N6G1 96 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.62■□□□□ 0.09
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PTPRM-201ENST00000332175 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.6■□□□□ 0.09
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PTPRM-201ENST00000332175 C1orf195Q5TG92 126 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV2-30P06310 120 aa15.57■□□□□ 0.08
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PTPRM-201ENST00000332175 LINC00846Q9NV44 126 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRM-201ENST00000332175 CRYGAP11844 174 aa15.57■□□□□ 0.08
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PTPRM-201ENST00000332175 Q8N2B8 174 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRM-201ENST00000332175 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRM-201ENST00000332175 Q9UF83 564 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRM-201ENST00000332175 MOBPQ13875 183 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRM-201ENST00000332175 PMAIP1Q13794 54 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00167Q96N53 147 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRM-201ENST00000332175 C7orf65Q6ZTY9 151 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRM-201ENST00000332175 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM29Q86T20 159 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf64Q8NEQ6 169 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM254Q8TBM7 123 aa15.48■□□□□ 0.07
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PTPRM-201ENST00000332175 LINC00315P59091 139 aa15.41■□□□□ 0.06
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PTPRM-201ENST00000332175 CXCL6P80162 114 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-201ENST00000332175 hDV103S1A0JD37 113 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01546A6NGU7 62 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRM-201ENST00000332175 COL4A2P08572 1712 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-201ENST00000332175 FAM218AQ96MZ4 157 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRBP23467 1997 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRM-201ENST00000332175 FAM229AH3BQW9 127 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRM-201ENST00000332175 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRM-201ENST00000332175 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
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