RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 H7C2G1 150 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 ERG28Q9UKR5 140 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 Q8IZM0 81 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 MALP21145 153 aa12.11□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 C2orf82Q6UX34 121 aa12.11□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 UBE2WQ96B02 151 aa12.1□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 H3BMG7 143 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 LINC00158P58513 81 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0087Q14695 138 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTB-201ENST00000331789 CRPP02741 224 aa12.08□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 PFN2P35080 140 aa12.08□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 Q1RN00 199 aa12.08□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.07□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 PSMB2P49721 201 aa12.07□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 COPS9Q8WXC6 57 aa12.07□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.06□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 CKS1BP61024 79 aa12.06□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 CFAP161Q6P656 301 aa12.06□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.04□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 TCL1BO95988 128 aa12.04□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.04□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.03□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 MTURNQ8N3F0 131 aa12.03□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.03□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.03□□□□□ -0.48
ACTB-201ENST00000331789 TRIAP1O43715 76 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 C6orf223Q8N319 242 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 CCL18P55774 89 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 SPAG11BQ08648 103 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 CXCL5P42830 114 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 PRO0461Q9UI25 63 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 WFDC2Q14508 124 aa12□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.99□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 B9D2Q9BPU9 175 aa11.99□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 F8W1H4 67 aa11.99□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 C10orf25Q5T742 122 aa11.99□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.99□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.98□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.97□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2D-28P01615 120 aa11.97□□□□□ -0.49
ACTB-201ENST00000331789 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 COX17Q14061 63 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 COL7A1Q02388 2944 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 COX6CP09669 75 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 Q9HAA7 133 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 CLEC2BQ92478 149 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 ATXN8Q156A1 80 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 C15orf56Q8N910 161 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 ETDBQ3ZM63 59 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-201ENST00000331789 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.9□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.89□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 C9JAW5 83 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 LINC01620Q4KN68 170 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 UPK3BQ9BT76 320 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.86□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 LST1O00453 97 aa11.86□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 Q8NDZ9 215 aa11.86□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.86□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.85□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 APLNQ9ULZ1 77 aa11.85□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 K7ERU9 68 aa11.84□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A20O43772 301 aa11.84□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZRU5 148 aa11.84□□□□□ -0.51
ACTB-201ENST00000331789 NDUFC2O95298 119 aa11.83□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 RNF151Q2KHN1 245 aa11.83□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 CASC10Q5T4H9 136 aa11.82□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 C2orf48Q96LS8 159 aa11.82□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 MUC7Q8TAX7 377 aa11.82□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 NCR3O14931 201 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.8□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.79□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.79□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 TEN1Q86WV5 123 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms