RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 REG3AQ06141 175 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR34Q9NV39 138 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 PRO0461Q9UI25 63 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 LYSTQ99698 3801 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 XCL1P47992 114 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE2BQ13066 116 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE2EQ4V326 116 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WZ39 114 aa6.34□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-33P01772 117 aa6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1-201ENST00000284957 CARD19Q96LW7 228 aa6.34□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 ENHOQ6UWT2 76 aa6.33□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.33□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0J9YXY3 114 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-201ENST00000284957 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-201ENST00000284957 LITAFQ99732 161 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-201ENST00000284957 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-201ENST00000284957 TAL2Q16559 108 aa6.32□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 M0QXV9 152 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 Q1RN00 199 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2WQ96B02 151 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 TEN1Q86WV5 123 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 COX7A2LO14548 114 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-201ENST00000284957 Q8IZM0 81 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGEF1-201ENST00000284957 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.25□□□□□ -1.41
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RABGEF1-201ENST00000284957 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.23□□□□□ -1.41
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RABGEF1-201ENST00000284957 C6orf223Q8N319 242 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 Q9HAA7 133 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 SPAG11BQ08648 103 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf25Q5T742 122 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.21□□□□□ -1.42
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