RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 ACYP1P07311 99 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UBE2D3P61077 147 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UBE2D2P62837 147 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 ITPR1Q14643 2758 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.96□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.96□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 MIFP14174 115 aa3.96□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.96□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 C3orf84H3BNL1 204 aa3.96□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 IGLV1-51P01701 117 aa3.96□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 XGP55808 180 aa3.96□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 C20orf197Q8N268 126 aa3.96□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WZ39 114 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 A0A0J9YWU9 116 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 SYCNQ0VAF6 134 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 A8MTW9 85 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 LINC00643Q86TS7 51 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 ENHOQ6UWT2 76 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZTC4 211 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.95□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 H7C423 109 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 C6orf223Q8N319 242 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 H0Y9J4 135 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 ATOX1O00244 68 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 LST1O00453 97 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 CITED1Q99966 193 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.94□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 CCKP06307 115 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 FHL2Q14192 279 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 SHISA2Q6UWI4 295 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 BPY2O14599 106 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 UPK3BQ9BT76 320 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 C5orf47Q569G3 176 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 LELP1Q5T871 98 aa3.93□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 LINC00315P59091 139 aa3.92□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.92□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 PRR4Q16378 134 aa3.92□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.92□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WVE0 104 aa3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 AMELXQ99217 191 aa3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.91□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 NDUFB1O75438 58 aa3.9□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 Q8N3U1 123 aa3.9□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 LRBAP50851 2863 aa3.9□□□□□ -1.78
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WYN8 130 aa3.9□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.9□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.9□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 TIMM17BO60830 172 aa3.9□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.9□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 SNURFQ9Y675 71 aa3.9□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 CCDC179H3BU77 68 aa3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 Q8N2B8 174 aa3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 CELA1Q9UNI1 258 aa3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 Q8IZM0 81 aa3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 USP17L23D6RBM5 183 aa3.88□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 MP68P56378 58 aa3.88□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.88□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 LY6G6CO95867 125 aa3.88□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 M0R378 163 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 IGKV4-1P06312 121 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 PDE6GP18545 87 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 B9D2Q9BPU9 175 aa3.87□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 UQCRQO14949 82 aa3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms