RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ido2Q8R0V5 405 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1475Q8VEV6 314 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr984Q8VFN1 314 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1408Q8VG32 310 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr167Q8VGJ5 312 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Insig2Q91WG1 225 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sfxn4Q925N1 313 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ms4a6dQ99N07 247 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm7Q9CQT2 265 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tex43Q9D9I1 141 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ly96Q9JHF9 160 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp53Q9Z117 652 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccpg1osV9GXK1 122 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Herc2Q4U2R1 4836 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SacsQ9JLC8 4582 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Iglv1A0A075B663 117 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-18A0A0A6YXN4 117 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrgpra9A0A140T8U8 332 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm37797A0A1D5RLC8 261 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pglyrp3A1A547 347 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krtap17-1A2A5X6 109 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psg18B2RSG7 476 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcnk15B2RVL1 343 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1406E9Q8X1 310 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8653K9J7G2 307 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn1r117L7N2C9 307 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mmp23O88676 391 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Iglc2P01844 104 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GzmbP04187 247 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnfrsf1aP25118 454 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc6a9P28571 692 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 KrasP32883 189 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chrna7P49582 502 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9Q3UKW5 162 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smim7Q5RKS2 75 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pafah1b2Q61206 229 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adora3Q61618 319 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hes3Q61657 175 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr43Q7TRX1 313 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr403Q7TRX2 313 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q80X32 188 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prr9Q8BV84 116 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prelid1Q8R107 217 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab11fip5Q8R361 645 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1384Q8VFA8 318 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr490Q8VFD2 314 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1370Q8VFG4 316 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1030Q8VFL5 318 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr355Q8VFP6 310 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1462Q8VFW3 307 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1404Q8VGE1 313 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pth2Q91W27 100 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr116Q923Q6 321 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ms4a6cQ99N08 217 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl51Q9CPY1 128 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CrygfQ9CXV3 174 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem128Q9CZB9 163 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prr15Q9D1T5 122 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem210Q9D2F0 147 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mettl9Q9EPL4 318 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mixl1Q9WUI0 231 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa4.12□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trbv12-2A0A0B4J1H1 124 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A0A286YDM5 308 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cldn34c4A2ANA3 212 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam229aB2KGE5 128 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20422E9PUR3 255 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr556E9Q549 324 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr64F8VPZ8 307 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20830J3KML6 227 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr906K7N5P3 311 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Degs1O09005 323 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sprr3O09116 238 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Foxh1O88621 401 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fut9O88819 359 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ypel3P61237 119 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcp4P63054 62 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hist1h1tQ07133 208 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1340Q3KPC7 315 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21748Q3UE70 102 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10447Q3UQ92 135 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trat1Q3UU67 187 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccl12Q62401 104 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bst1Q64277 311 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr907Q7TRC7 310 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smim19Q80ZU4 107 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9961Q8BNV2 113 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm26566Q8CAC1 153 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AmtQ8CFA2 403 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scgb2b26Q8JZX1 112 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FuomQ8R2K1 153 aa4.11□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr113Q8VEU4 312 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.8 ms