Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Hes3Q61657 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hes3Q61657 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hes3Q61657 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hes3Q61657 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hes3Q61657 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hes3Q61657 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hes3Q61657 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hes3Q61657 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Hes3Q61657 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hes3Q61657 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hes3Q61657 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hes3Q61657 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hes3Q61657 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Hes3Q61657 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hes3Q61657 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hes3Q61657 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hes3Q61657 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hes3Q61657 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hes3Q61657 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hes3Q61657 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hes3Q61657 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hes3Q61657 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hes3Q61657 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hes3Q61657 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hes3Q61657 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hes3Q61657 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hes3Q61657 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hes3Q61657 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hes3Q61657 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hes3Q61657 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hes3Q61657 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hes3Q61657 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hes3Q61657 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hes3Q61657 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hes3Q61657 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hes3Q61657 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hes3Q61657 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hes3Q61657 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hes3Q61657 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hes3Q61657 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hes3Q61657 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hes3Q61657 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hes3Q61657 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hes3Q61657 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hes3Q61657 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hes3Q61657 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hes3Q61657 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hes3Q61657 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hes3Q61657 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hes3Q61657 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hes3Q61657 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hes3Q61657 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hes3Q61657 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hes3Q61657 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hes3Q61657 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hes3Q61657 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hes3Q61657 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hes3Q61657 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hes3Q61657 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hes3Q61657 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hes3Q61657 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hes3Q61657 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hes3Q61657 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hes3Q61657 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hes3Q61657 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hes3Q61657 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hes3Q61657 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hes3Q61657 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hes3Q61657 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hes3Q61657 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hes3Q61657 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hes3Q61657 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hes3Q61657 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hes3Q61657 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hes3Q61657 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hes3Q61657 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hes3Q61657 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hes3Q61657 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hes3Q61657 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hes3Q61657 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hes3Q61657 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hes3Q61657 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hes3Q61657 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hes3Q61657 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hes3Q61657 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hes3Q61657 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hes3Q61657 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hes3Q61657 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hes3Q61657 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hes3Q61657 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hes3Q61657 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hes3Q61657 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hes3Q61657 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hes3Q61657 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hes3Q61657 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms