Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA2

Amt, Aminomethyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmtQ8CFA2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AmtQ8CFA2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AmtQ8CFA2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AmtQ8CFA2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AmtQ8CFA2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AmtQ8CFA2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AmtQ8CFA2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AmtQ8CFA2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AmtQ8CFA2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmtQ8CFA2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AmtQ8CFA2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmtQ8CFA2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmtQ8CFA2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AmtQ8CFA2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AmtQ8CFA2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AmtQ8CFA2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmtQ8CFA2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AmtQ8CFA2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AmtQ8CFA2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AmtQ8CFA2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AmtQ8CFA2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmtQ8CFA2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AmtQ8CFA2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AmtQ8CFA2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AmtQ8CFA2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AmtQ8CFA2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmtQ8CFA2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmtQ8CFA2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmtQ8CFA2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AmtQ8CFA2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AmtQ8CFA2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmtQ8CFA2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AmtQ8CFA2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmtQ8CFA2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmtQ8CFA2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AmtQ8CFA2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AmtQ8CFA2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmtQ8CFA2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmtQ8CFA2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AmtQ8CFA2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmtQ8CFA2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmtQ8CFA2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmtQ8CFA2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AmtQ8CFA2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AmtQ8CFA2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmtQ8CFA2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmtQ8CFA2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AmtQ8CFA2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmtQ8CFA2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmtQ8CFA2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AmtQ8CFA2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AmtQ8CFA2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AmtQ8CFA2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AmtQ8CFA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AmtQ8CFA2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmtQ8CFA2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AmtQ8CFA2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AmtQ8CFA2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AmtQ8CFA2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AmtQ8CFA2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmtQ8CFA2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmtQ8CFA2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmtQ8CFA2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AmtQ8CFA2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmtQ8CFA2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmtQ8CFA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmtQ8CFA2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmtQ8CFA2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmtQ8CFA2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmtQ8CFA2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmtQ8CFA2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmtQ8CFA2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmtQ8CFA2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AmtQ8CFA2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmtQ8CFA2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmtQ8CFA2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmtQ8CFA2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmtQ8CFA2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmtQ8CFA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmtQ8CFA2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmtQ8CFA2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmtQ8CFA2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmtQ8CFA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmtQ8CFA2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmtQ8CFA2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AmtQ8CFA2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AmtQ8CFA2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmtQ8CFA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AmtQ8CFA2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AmtQ8CFA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AmtQ8CFA2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmtQ8CFA2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmtQ8CFA2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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