RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN13O95857 204 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NRACQ8N912 160 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R2P9O14990 202 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RIGQ13278 110 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 IFITM10A6NMD0 228 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC51BQ86UW2 128 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 HBBP68871 147 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM7Q9BQ49 75 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01551Q86U37 167 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OSTCQ9NRP0 149 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TCAPO15273 167 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF861PO60384 105 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf78Q9BR46 151 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf82Q6UX34 121 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM104AQ969W3 186 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CKS2P33552 79 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0087Q14695 138 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF727A8MUV8 499 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 BLOC1S1P78537 153 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GYV3 84 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00862A6NCI5 91 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 NAT8BQ9UHF3 227 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 NUPR1O60356 82 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF6BO95407 300 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TYMSOSQ8TAI1 123 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CTDSP1Q9GZU7 261 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ALKAL2Q6UX46 152 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00469Q8N7U9 141 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087X002 238 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C22orf24Q9Y442 160 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYGAP11844 174 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 D6R8Y8 96 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS2P07478 247 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTE3Q8IZS6 198 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL28P46779 137 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NPYP01303 97 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TOMM7Q9P0U1 55 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB5AP20339 215 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RETNLBQ9BQ08 111 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 XAGE1AQ9HD64 81 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CKS1BP61024 79 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GW15 77 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM141Q96I45 108 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SRP19P09132 144 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CDIP1Q9H305 208 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 BCE1O60756 84 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ADIRFQ15847 76 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 F8W036 122 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01561Q8N1V8 128 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf88Q9BSF0 95 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A8P05109 93 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf226Q5I0X4 101 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC11Q9NYG5 84 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL23P62829 140 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZN92 141 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PPBPP02775 128 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC17Q685J3 4493 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL37AP8A6NKH3 93 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8IZM0 81 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ORMDL3Q8N138 153 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00304Q8N9R0 145 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PRELID3AQ96N28 172 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2AP49459 152 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 VCX2Q9H322 139 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 NAT8Q9UHE5 227 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa15.91■□□□□ 0.14
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