RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-208ENST00000614825 A0A1B0GXF2 115 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 APOMO95445 188 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 RAB5AP20339 215 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 RAB14P61106 215 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.28□□□□□ -1.24
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DDB2-208ENST00000614825 PPBPP02775 128 aa7.28□□□□□ -1.24
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DDB2-208ENST00000614825 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 SPAG11BQ08648 103 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 ORMDL3Q8N138 153 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 PRELID3AQ96N28 172 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 A0A0J9YXV3 536 aa7.27□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 PTTG1IPP53801 180 aa7.27□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.27□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.27□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 MT-ND4LP03901 98 aa7.26□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 C2orf48Q96LS8 159 aa7.25□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.25□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.24□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 MT1HL1P0DM35 61 aa7.24□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.24□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 FAM104AQ969W3 186 aa7.24□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 A0A1W2PNN7 141 aa7.23□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 Q6ZRP5 223 aa7.23□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.22□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 NDUFA1O15239 70 aa7.22□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 TMEM141Q96I45 108 aa7.22□□□□□ -1.25
DDB2-208ENST00000614825 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 MT-ND6P03923 174 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 S100A1P23297 94 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 C10orf25Q5T742 122 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 UQCC3Q6UW78 93 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.21□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 GAGE2EQ4V326 116 aa7.2□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.2□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.2□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 Q6ZN92 141 aa7.2□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDB2-208ENST00000614825 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDB2-208ENST00000614825 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.19□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 RNF151Q2KHN1 245 aa7.19□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.19□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 REG3GQ6UW15 175 aa7.19□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 VCX2Q9H322 139 aa7.19□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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DDB2-208ENST00000614825 A0A087WZ39 114 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 FAM168BA1KXE4 195 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 ATP6V1G1O75348 118 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 C1orf137Q5JT78 98 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 C2orf82Q6UX34 121 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 LINC01600Q96MT4 127 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.18□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 GAGE10A6NGK3 116 aa7.17□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 F8WDY8 70 aa7.17□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 UBE2D1P51668 147 aa7.17□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.17□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 COMMD7Q86VX2 200 aa7.17□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 PRSS2P07478 247 aa7.16□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.267e-8■■□□□ 12.7
DDB2-208ENST00000614825 KIAA0087Q14695 138 aa7.15□□□□□ -1.26
DDB2-208ENST00000614825 TMEM218A2RU14 115 aa7.14□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 ADCYAP1P18509 176 aa7.14□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 CKS1BP61024 79 aa7.14□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 UBE2BP63146 152 aa7.14□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.14□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 IGIPA6NJ69 53 aa7.13□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 S100PP25815 95 aa7.13□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.13□□□□□ -1.27
DDB2-208ENST00000614825 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.13□□□□□ -1.27
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