RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 GYPEP15421 78 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 C12orf74Q32Q52 190 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 PCP2Q8IVA1 136 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRAPQ8TCY5 172 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRO0461Q9UI25 63 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 DPM2O94777 84 aa6.19□□□□□ -1.42
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PRKAR1A-211ENST00000586397 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.18□□□□□ -1.42
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PRKAR1A-211ENST00000586397 TENM3Q9P273 2699 aa6.17□□□□□ -1.42
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PRKAR1A-211ENST00000586397 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.17□□□□□ -1.42
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PRKAR1A-211ENST00000586397 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.17□□□□□ -1.42
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PRKAR1A-211ENST00000586397 Q6Q795 121 aa6.15□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 TEN1Q86WV5 123 aa6.15□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 HIST1H4GQ99525 98 aa6.15□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.15□□□□□ -1.42
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PRKAR1A-211ENST00000586397 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.11□□□□□ -1.43
PRKAR1A-211ENST00000586397 C11orf86A6NJI1 115 aa6.1□□□□□ -1.43
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PRKAR1A-211ENST00000586397 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
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PRKAR1A-211ENST00000586397 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.08□□□□□ -1.44
PRKAR1A-211ENST00000586397 COL7A1Q02388 2944 aa6.08□□□□□ -1.44
PRKAR1A-211ENST00000586397 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.07□□□□□ -1.44
PRKAR1A-211ENST00000586397 PSMB2P49721 201 aa6.07□□□□□ -1.44
PRKAR1A-211ENST00000586397 HERVK_113P61574 105 aa6.07□□□□□ -1.44
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.07□□□□□ -1.44
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