RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM223A0PJW6 202 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-209ENST00000532457 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-209ENST00000532457 PRR34Q9NV39 138 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-209ENST00000532457 CTAG1AP78358 180 aa14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.83□□□□□ -0.04
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PACSIN3-209ENST00000532457 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 HERVK_113P63121 156 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 PCP2Q8IVA1 136 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 UPK3BQ9BT76 320 aa14.8□□□□□ -0.04
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PACSIN3-209ENST00000532457 E9PLD3 99 aa14.8□□□□□ -0.04
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PACSIN3-209ENST00000532457 SEC11AP67812 179 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 M0R143 59 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACSIN3-209ENST00000532457 SS18Q15532 418 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-209ENST00000532457 UBE2WQ96B02 151 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACSIN3-209ENST00000532457 COX8AP10176 69 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 C5orf38Q86SI9 138 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.75□□□□□ -0.05
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PACSIN3-209ENST00000532457 HERVK_113P61574 105 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 LEPROTO15243 131 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A087WZ39 114 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 H3BRM9 83 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 FOXI1Q12951 378 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-209ENST00000532457 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.72□□□□□ -0.05
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PACSIN3-209ENST00000532457 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.71□□□□□ -0.05
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PACSIN3-209ENST00000532457 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.69□□□□□ -0.06
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PACSIN3-209ENST00000532457 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-209ENST00000532457 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-209ENST00000532457 DLEU1O43261 78 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-209ENST00000532457 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.67□□□□□ -0.06
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PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF815PA8K554 130 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 COX7A2LO14548 114 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 BATFQ16520 125 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 K7EP13 123 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACSIN3-209ENST00000532457 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACSIN3-209ENST00000532457 TTC32Q5I0X7 151 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 COX7B2Q8TF08 81 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A1B0GV90 55 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 MALP21145 153 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA0087Q14695 138 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-209ENST00000532457 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.58□□□□□ -0.08
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PACSIN3-209ENST00000532457 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.57□□□□□ -0.08
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PACSIN3-209ENST00000532457 RYR2Q92736 4967 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-209ENST00000532457 NDUFA1O15239 70 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A0J9YXY3 114 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-209ENST00000532457 M0R2N4 97 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-209ENST00000532457 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-209ENST00000532457 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-209ENST00000532457 HIGD1BQ9P298 99 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.54□□□□□ -0.08
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