RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SIGMAR1Q99720 223 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LITAFQ99732 161 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRO0461Q9UI25 63 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.78□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.77□□□□□ -1.65
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.77□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q9H8V8 135 aa4.77□□□□□ -1.65
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.76□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.76□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.76□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.76□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DAD1P61803 113 aa4.76□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WFDC2Q14508 124 aa4.76□□□□□ -1.65
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 COX7A2LO14548 114 aa4.75□□□□□ -1.65
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 GYPEP15421 78 aa4.75□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNF151Q2KHN1 245 aa4.75□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LINC01620Q4KN68 170 aa4.75□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.75□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LELP1Q5T871 98 aa4.75□□□□□ -1.65
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.74□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NOTCH2Q04721 2471 aa4.74□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 INAFM1C9JVW0 142 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CRPP02741 224 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRM2P04554 102 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DEFB130BP0DP73 79 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DEFB130AP0DP74 79 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COX6A2Q02221 97 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.73□□□□□ -1.65
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q9UF83 564 aa4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C9JAW5 83 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRIAP1O43715 76 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MALP21145 153 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTAP10-3P60369 221 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CKS1BP61024 79 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE6Q13070 117 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C2orf82Q6UX34 121 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.72□□□□□ -1.65
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LINC00158P58513 81 aa4.71□□□□□ -1.66
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEC61GP60059 68 aa4.71□□□□□ -1.66
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C5orf47Q569G3 176 aa4.71□□□□□ -1.66
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q6Q795 121 aa4.71□□□□□ -1.66
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