RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP6V1G1	O75348	118 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	SLPI	P03973	132 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	KRTAP10-8	P60410	259 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	TRGC2	P03986	189 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	ESD	P10768	282 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	RAB5B	P61020	215 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	SS18	Q15532	418 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	MIA	Q16674	131 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170		K7EMI3	77 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	LINC00614	P0C842	121 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170		Q6ZN92	141 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A0J9YXV3	536 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	COLCA2	A8K830	154 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	NDUFA6	P56556	154 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	VCX2	Q9H322	139 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MKNK1-222	ENST00000529170	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	XCL1	P47992	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170		Q6ZUT4	128 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	hDV102S1	A0JD36	115 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	IFITM10	A6NMD0	228 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	CCL25	O15444	150 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	HSBP1	O75506	76 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	MAL	P21145	153 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	MUC2	Q02817	5179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	LINC01549	A6NIU2	74 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	HBD	P02042	147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.18	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	ERAS	Q7Z444	233 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170		H0Y8G0	127 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	COX6A2	Q02221	97 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	C5orf38	Q86SI9	138 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	IGIP	A6NJ69	53 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	COX7A2L	O14548	114 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP5L	O75964	103 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	APOM	O95445	188 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	MAJIN	Q3KP22	176 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	TIMM17A	Q99595	171 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKNK1-222	ENST00000529170	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MKNK1-222	ENST00000529170	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MKNK1-222	ENST00000529170	SERF1A	O75920	110 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MKNK1-222	ENST00000529170	FABP4	P15090	132 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MKNK1-222	ENST00000529170	SEC11A	P67812	179 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MKNK1-222	ENST00000529170	STPG4	Q8N801	248 aa		5.15	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms