RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516099.1

RNU6-491P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 491, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-491P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-491P-201ENST00000516099 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF292O60281 2723 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 KRTDAPP60985 99 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 MYO7BQ6PIF6 2116 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 RBP2P50120 134 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 ABCC5O15440 1437 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-491P-201ENST00000516099 SPTBN2O15020 2390 aa0.53□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.53□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 NCOR1O75376 2440 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 S100A10P60903 97 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 COL6A3P12111 3177 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 SEC11AP67812 179 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 C2CD3Q4AC94 2353 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 NUP188Q5SRE5 1749 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM223BA6NKX1 122 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 C10orf142B7Z368 130 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 Q8IZM0 81 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 SPRR4Q96PI1 79 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 STAB1Q9NY15 2570 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 NHSL1Q5SYE7 1610 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 GNGT2O14610 69 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 PAPPAQ13219 1627 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRANK1O15050 2925 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 CNTLNQ9NXG0 1405 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 I3L2K1 104 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 ADGRL2O95490 1459 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 LRRK2Q5S007 2527 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-491P-201ENST00000516099 COL4A6Q14031 1691 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 A0A1B0GWA3 101 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZFHX3Q15911 3703 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 FDCSPQ8NFU4 85 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 MRC2Q9UBG0 1479 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 MT-ATP8P03928 68 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 U3KQA8 63 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 VWFP04275 2813 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 COL6A5A8TX70 2615 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 USF3Q68DE3 2245 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 WFDC2Q14508 124 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 LINC01600Q96MT4 127 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 UBR4Q5T4S7 5183 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 CREBBPQ92793 2442 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 A0A0G2JND7 137 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 PIGYQ3MUY2 71 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 LCN9Q8WX39 176 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 PMCHL2Q9BQD1 86 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 AP4S1Q9Y587 144 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 MUC2Q02817 5179 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 ACACBO00763 2458 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 KIAA1109Q2LD37 5005 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 ITPR3Q14573 2671 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 NCMAPQ5T1S8 102 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 ACBD7Q8N6N7 88 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 PRO1933Q9H354 126 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 C1orf167Q5SNV9 1468 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 KMT2DO14686 5537 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-491P-201ENST00000516099 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 MPC2O95563 127 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 CACFD1Q9UGQ2 172 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms