RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	NPS	P0C0P6	89 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC11A	P67812	179 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf38	Q86SI9	138 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SNAPIN	O95295	136 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCYAP1	P18509	176 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WYN8	130 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFA1	O15239	70 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SLPI	P03973	132 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SVBP	Q8N300	66 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS2	P07478	247 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	FA2H	Q7L5A8	372 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	STPG4	Q8N801	248 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	APOC3	P02656	99 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CHTF8	P0CG12	524 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	HERVK_113	P63121	156 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZRU5	148 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TIMM17A	Q99595	171 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WZ39	114 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A096LNI7	61 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB5B	P61020	215 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CKS1B	P61024	79 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TOMM6	Q96B49	74 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2D1	P51668	147 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PANO1	I0J062	215 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	OXT	P01178	125 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	AMELX	Q99217	191 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	IGIP	A6NJ69	53 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	FAT1	Q14517	4588 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BRM9	83 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZRP5	223 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL5	P42830	114 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFA6	P56556	154 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	PMVK	Q15126	192 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00614	P0C842	121 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246		Q8IZM0	81 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM104A	Q969W3	186 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-231	ENST00000496246	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0J9YXV3	536 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	HBD	P02042	147 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01546	A6NGU7	62 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5L	O75964	103 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.13	□□□□□ -1.27

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