RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV1-47P01700 117 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-213ENST00000496055 FXYD7P58549 80 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-213ENST00000496055 SYCNQ0VAF6 134 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-213ENST00000496055 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0J9YXV3 536 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM223A0PJW6 202 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS1P07477 247 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 DAND5Q8N907 189 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF580Q9UK33 172 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0G2JRQ6 117 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 H7C2G1 150 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 SH2D1AO60880 128 aa3.27□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.26□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZRP5 223 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 Q1RN00 199 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf90A8MZG2 172 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf77C9JDV5 145 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 TRGV3P03979 118 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 C15orf32Q32M92 178 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BUA1 57 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 TRIAP1O43715 76 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-30P01768 117 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 PRM2P04554 102 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 MIFP14174 115 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 LEAP2Q969E1 77 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP10-11P60412 298 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZS46 218 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 PLNP26678 52 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 PIGYQ3MUY2 71 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8N9W7 124 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV1D-12P01611 117 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 Q8N6K4 173 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM141Q96I45 108 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 ORMDL3Q8N138 153 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-213ENST00000496055 HCG22E2RYF7 251 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-11P01762 117 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf83Q53S99 150 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 CASC10Q5T4H9 136 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 UBALD1Q8TB05 177 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 NPBQ8NG41 125 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-213ENST00000496055 CELA1Q9UNI1 258 aa3.22□□□□□ -1.89
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