RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	PAPPA	Q13219	1627 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188		A0A0D9SFI3	127 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188		H3BQ15	152 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	UBE2D3	P61077	147 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	UBE2D2	P62837	147 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	GNGT2	O14610	69 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	MGP	P08493	103 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	COX6C	P09669	75 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	KRTDAP	P60985	99 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	SEC11A	P67812	179 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188		Q5BKY6	102 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	FAM223B	A6NKX1	122 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	C10orf142	B7Z368	130 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	S100A3	P33764	101 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	CNFN	Q9BYD5	112 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	DNAJC13	O75165	2243 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188		A0A0G2JND7	137 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188		A0A1B0GWA3	101 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	MPC2	O95563	127 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	MT-ATP8	P03928	68 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	AP4S1	Q9Y587	144 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	ADGRL2	O95490	1459 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	SHPRH	Q149N8	1683 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	ASIP	P42127	132 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	LCN9	Q8WX39	176 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	SPRR4	Q96PI1	79 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	C5	P01031	1676 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	NLRP1	Q9C000	1473 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	NCOR1	O75376	2440 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188		Q8IZM0	81 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188		A0A087WVE0	104 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188		I3L2K1	104 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188		M0R143	59 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	LINC01600	Q96MT4	127 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF292	O60281	2723 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188		A0A0G2JMZ2	1700 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	NDUFC1	O43677	76 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	S100A8	P05109	93 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	LINC00032	P0C843	101 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	PRO1933	Q9H354	126 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RNF146-208	ENST00000495188	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RNF146-208	ENST00000495188	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RNF146-208	ENST00000495188	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RNF146-208	ENST00000495188	ATOX1	O00244	68 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RNF146-208	ENST00000495188	UQCRH	P07919	91 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RNF146-208	ENST00000495188	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38

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