RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 GAS8-AS1O95177 125 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 LINC00474Q9P2X8 69 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 NUPR2A6NF83 97 aa12.33□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 A8MZ25 164 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 ADAMTS20P59510 1910 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 UPK3BQ9BT76 320 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 EXPH5Q8NEV8 1989 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 BEAN1Q3B7T3 259 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 SLPIP03973 132 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 A0A096LNI7 61 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 LY6G6CO95867 125 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 M0R2N4 97 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 Q8N2B8 174 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 FHL2Q14192 279 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 LST1O00453 97 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2D-28P01615 120 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 CYSRT1A8MQ03 144 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 LINC00310P59036 64 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 CEP295Q9C0D2 2601 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZQY7 126 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 CCKP06307 115 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 RETNQ9HD89 108 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 SMIM11BQ8TCY0 68 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 F8WDY8 70 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 COL4A2P08572 1712 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 J3KT08 172 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 IGKV4-1P06312 121 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZTC4 211 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-213ENST00000489895 ABCA12Q86UK0 2595 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 AMELXQ99217 191 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 JMJD1CQ15652 2540 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 EML5Q05BV3 1969 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GUV1 79 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 MT-ATP8P03928 68 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 UQCRQO14949 82 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 IMUPQ9GZP8 106 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 C5orf47Q569G3 176 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 ENHOQ6UWT2 76 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 LINC00694P0DN24 101 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-213ENST00000489895 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.15□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 SEC61GP60059 68 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 COX6A2Q02221 97 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 SCXQ7RTU7 201 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 TLN2Q9Y4G6 2542 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 M0QXV9 152 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 LYPD5Q6UWN5 251 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 USP17L23D6RBM5 183 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 C2orf48Q96LS8 159 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 C3orf84H3BNL1 204 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 RPL28P46779 137 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 C20orf197Q8N268 126 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 A0A096LNJ9 63 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZSN1 163 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 CASC2Q6XLA1 102 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-213ENST00000489895 NDUFC2O95298 119 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 C6orf223Q8N319 242 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 LRRK2Q5S007 2527 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.07□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 FN1P02751 2386 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
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