RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 C20orf202A1L168 122 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 F8VRH5 84 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GVY2 172 aa7.84□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 C3orf79P0CE67 100 aa7.84□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 PLNP26678 52 aa7.84□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.84□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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NISCH-211ENST00000488243 KRTDAPP60985 99 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 ODF1Q14990 250 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 C6orf223Q8N319 242 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 HERC1Q15751 4861 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 PKD1P98161 4303 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 LINC01545Q5VT33 79 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 Q9HAA7 133 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YXV3 536 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 H3BRM9 83 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 DPM2O94777 84 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WZ39 114 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 H0Y8G0 127 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 COX7A2LO14548 114 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 APOMO95445 188 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 IGKCP01834 107 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 XCL1P47992 114 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 FOXI1Q12951 378 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 CFAP161Q6P656 301 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 C11orf86A6NJI1 115 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 M0R2N4 97 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 PSCAO43653 123 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 RTL8CO15255 209 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 MALP21145 153 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-211ENST00000488243 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 COX6A2Q02221 97 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 C14orf177Q52M58 125 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 F8WDY8 70 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 HERVK_113P61574 105 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 SCGB1D1O95968 90 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 C5orf38Q86SI9 138 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 TMEM223A0PJW6 202 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 EREGO14944 169 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 SFTA2Q6UW10 78 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 Q8IZM0 81 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 USP17L23D6RBM5 183 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 CXCL5P42830 114 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 C2orf48Q96LS8 159 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-211ENST00000488243 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 E9PLD3 99 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 PRSS2P07478 247 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 C15orf56Q8N910 161 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 LEPROTO15243 131 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 SPINK8P0C7L1 97 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 COX7B2Q8TF08 81 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WTM6 91 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 NMUP48645 174 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 SPAG11BQ08648 103 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 PYY3Q5JQD4 70 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 hDV102S1A0JD36 115 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 SMIM6P0DI80 62 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 CKS1BP61024 79 aa7.68□□□□□ -1.18
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