RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 IGIPA6NJ69 53 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 UBE2L6O14933 153 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 PRSS1P07477 247 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 FABP4P15090 132 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 LINC01549A6NIU2 74 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 LEPROTL1O95214 131 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 S100A2P29034 98 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 RBX1P62877 108 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 C14orf177Q52M58 125 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 ERASQ7Z444 233 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 TIMM17AQ99595 171 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GUV1 79 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 PANO1I0J062 215 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 PKIAP61925 76 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZUT4 128 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 TMEM141Q96I45 108 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 ATP5LO75964 103 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 MIAQ16674 131 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 PRR34Q9NV39 138 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 NPSP0C0P6 89 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 TMEM101Q96IK0 257 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 AMELXQ99217 191 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 OXTP01178 125 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 C3orf79P0CE67 100 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 KRTDAPP60985 99 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 REG3AQ06141 175 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZN92 141 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 VCX2Q9H322 139 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 CST9LQ9H4G1 147 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-212ENST00000485532 H0Y8G0 127 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 PMVKQ15126 192 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 SLPIP03973 132 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 hDV102S1A0JD36 115 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 CHTF8P0CG12 524 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 ODF1Q14990 250 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 PET117Q6UWS5 81 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 UBE2D1P51668 147 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 LINC01545Q5VT33 79 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 A0A0J9YXV3 536 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 F8VRH5 84 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 IGLC3P0DOY3 106 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 C11orf86A6NJI1 115 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 MT1HL1P0DM35 61 aa8.02□□□□□ -1.13
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