RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479779.1

SYS1-208, Transcript of SYS1, golgi trafficking protein, human

TSL 2

Gene SYS1, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYS1-208	ENST00000479779	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		5	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	VCX2	Q9H322	139 aa		5	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	FAT1	Q14517	4588 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779		Q6ZUT4	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	LINC00614	P0C842	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	WFDC2	Q14508	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYS1-208	ENST00000479779	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	PRSS1	P07477	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	FOXI1	Q12951	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779		F8WDY8	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	ATP5L	O75964	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	HBD	P02042	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	PRSS2	P07478	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	HERVK_113	P63121	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	HSBP1	O75506	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	NDUFA6	P56556	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779		H3BRM9	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	UBE2D1	P51668	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	PMVK	Q15126	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	AMELX	Q99217	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779		A0A087WZ39	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	NDUFA1	O15239	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	TRGC2	P03986	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	S100A1	P23297	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	CKS1B	P61024	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	HAMP	P81172	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1-208	ENST00000479779	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779		A0A0J9YXV3	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	COLCA2	A8K830	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	CXCL5	P42830	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	COX6A2	Q02221	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779		Q6ZSA8	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	OXT	P01178	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYS1-208	ENST00000479779	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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