RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461912.1

SUMF2-215, Transcript of sulfatase modifying factor 2, humanhuman

TSL 4

Gene SUMF2, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF2-215ENST00000461912 NUPR2A6NF83 97 aa7.24□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 LEPROTO15243 131 aa7.24□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 CRPP02741 224 aa7.24□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 MAJINQ3KP22 176 aa7.24□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.23□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 K7EP13 123 aa7.23□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 SFTA2Q6UW10 78 aa7.23□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.23□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 TMEM223A0PJW6 202 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 LINC00587B1AMM8 73 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 J3QQQ9 107 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 GCSHP23434 173 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 REG3AQ06141 175 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 ESRGQ1W209 222 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 MPV17L2Q567V2 206 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.21□□□□□ -1.25
SUMF2-215ENST00000461912 M0R143 59 aa7.21□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 APOMO95445 188 aa7.21□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.21□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.21□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 ZNF815PA8K554 130 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 PRSS2P07478 247 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 MALP21145 153 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 MIAQ16674 131 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 FAM104AQ969W3 186 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 RMI2Q96E14 147 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 HIGD1BQ9P298 99 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.2□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.19□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.19□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 COPS9Q8WXC6 57 aa7.19□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 KLK12Q9UKR0 248 aa7.19□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.19□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 COX7A2LO14548 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGHV3-30P01768 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGHV3-33P01772 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 HERV-K104P63124 156 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 CTAG1AP78358 180 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 TAL2Q16559 108 aa7.18□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 A0A087WZ39 114 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 SPINK8P0C7L1 97 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 XCL1P47992 114 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 CFAP161Q6P656 301 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 PCP2Q8IVA1 136 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 UBE2WQ96B02 151 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 COX11Q9Y6N1 276 aa7.17□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 TMEM238C9JI98 176 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 LY6G6CO95867 125 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 COX6A2Q02221 97 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 Q6ZVH6 145 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 HIST1H4GQ99525 98 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 UPK3BQ9BT76 320 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 PRR34Q9NV39 138 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.16□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 A6NDN8 102 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 A6NJY4 79 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 CKS1BP61024 79 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 HSD52Q0P140 79 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 Q9H8V8 135 aa7.15□□□□□ -1.26
SUMF2-215ENST00000461912 CXCL5P42830 114 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 PTTG1IPP53801 180 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 C5orf38Q86SI9 138 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 COX7B2Q8TF08 81 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.14□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.13□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.13□□□□□ -1.27
SUMF2-215ENST00000461912 NDUFA1O15239 70 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.1 ms