RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 FAM218AQ96MZ4 157 aa10.68□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 ITPR3Q14573 2671 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 CXCL5P42830 114 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 C3orf22Q8N5N4 141 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFA7O95182 113 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 INSP01308 110 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 CUBNO60494 3623 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 ACANP16112 2415 aa10.67□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 F5H768 121 aa10.67□□□□□ -0.7
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TOP3B-206ENST00000436282 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.66□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.66□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PRX2 142 aa10.66□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 C5orf38Q86SI9 138 aa10.66□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.66□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 CHD6Q8TD26 2715 aa10.65□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 NF1P21359 2839 aa10.65□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 PF4P02776 101 aa10.65□□□□□ -0.7
TOP3B-206ENST00000436282 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa10.65□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 MTORP42345 2549 aa10.64□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10.64□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.64□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.64□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 MALP21145 153 aa10.63□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.63□□□□□ -0.71
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TOP3B-206ENST00000436282 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.63□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.63□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP161Q6P656 301 aa10.63□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.62□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 CRPP02741 224 aa10.62□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 Q9HAA7 133 aa10.62□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 K7EQD1 137 aa10.61□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.61□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 IL17DQ8TAD2 202 aa10.61□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa10.6□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.6□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.59□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 COX7CP15954 63 aa10.59□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.59□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 XCL2Q9UBD3 114 aa10.59□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
TOP3B-206ENST00000436282 JMJD1CQ15652 2540 aa10.58□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa10.58□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2D-28P01615 120 aa10.58□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.58□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 DNAL4O96015 105 aa10.58□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.58□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf158Q8N1D5 194 aa10.57□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.57□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 ATOX1O00244 68 aa10.57□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 COX7B2Q8TF08 81 aa10.57□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 C2orf48Q96LS8 159 aa10.57□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 ESM1Q9NQ30 184 aa10.57□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2L6O14933 153 aa10.56□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM243Q9BU79 118 aa10.56□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WYN8 130 aa10.55□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZTI0 123 aa10.55□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM11BQ8TCY0 68 aa10.55□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 H0YGX0 51 aa10.55□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 CRYGAP11844 174 aa10.55□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 CCL24O00175 119 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 STHQ8IWL8 128 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.54□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 AKAP9Q99996 3911 aa10.53□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM86BQ8N661 226 aa10.53□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.53□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00158P58513 81 aa10.52□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 Q6JHZ5 121 aa10.52□□□□□ -0.72
TOP3B-206ENST00000436282 CCL18P55774 89 aa10.52□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 TENM4Q6N022 2769 aa10.52□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GX51 115 aa10.51□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.51□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 19.3
TOP3B-206ENST00000436282 ITPR2Q14571 2701 aa10.5□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 J3KT08 172 aa10.5□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00846Q9NV44 126 aa10.5□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.49□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 LECT2O14960 151 aa10.49□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.48□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa10.48□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 NOTCH2Q04721 2471 aa10.48□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV25A0A0B4J276 109 aa10.48□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 hADV29S1A0JD25 119 aa10.48□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.48□□□□□ -0.73
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa10.47□□□□□ -0.73
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