RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKR1D1P51857 326 aa6.93□□□□□ -1.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.93□□□□□ -1.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TM2D2Q9BX73 214 aa6.93□□□□□ -1.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.92□□□□□ -1.3
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.92□□□□□ -1.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PSCAO43653 123 aa6.92□□□□□ -1.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HERVK_113P63121 156 aa6.92□□□□□ -1.3
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.9□□□□□ -1.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.9□□□□□ -1.3
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.9□□□□□ -1.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM104AQ969W3 186 aa6.9□□□□□ -1.3
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX7A2LO14548 114 aa6.89□□□□□ -1.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DPM2O94777 84 aa6.89□□□□□ -1.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLC3P0DOY3 106 aa6.89□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C6orf223Q8N319 242 aa6.89□□□□□ -1.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.89□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKCP01834 107 aa6.88□□□□□ -1.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.88□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZR54 194 aa6.88□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GHRHP01286 108 aa6.87□□□□□ -1.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HERVK_113P61574 105 aa6.87□□□□□ -1.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC01545Q5VT33 79 aa6.87□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.85□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.85□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.84□□□□□ -1.31
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.84□□□□□ -1.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.83□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX6A2Q02221 97 aa6.83□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.82□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPINK8P0C7L1 97 aa6.82□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.82□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.82□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L23D6RBM5 183 aa6.81□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPAG11BQ08648 103 aa6.81□□□□□ -1.32
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.81□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATOH7Q8N100 152 aa6.81□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.81□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 hDV102S1A0JD36 115 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM223A0PJW6 202 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYSTQ99698 3801 aa6.8□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LECT2O14960 151 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXCL5P42830 114 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CKS1BP61024 79 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SFTA2Q6UW10 78 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8IZM0 81 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX7B2Q8TF08 81 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VAMP8Q9BV40 100 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 F8WDY8 70 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LEPROTO15243 131 aa6.78□□□□□ -1.32
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