RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 TSTD3H0UI37 97 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 RHODO00212 210 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00614P0C842 121 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 MPV17L2Q567V2 206 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 LRP2P98164 4655 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 M0R381 172 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.17□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PRELID3AQ96N28 172 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 D6R8Y8 96 aa4.17□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 DDTP30046 118 aa4.17□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.16□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZRU5 148 aa4.15□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 AP1S3Q96PC3 154 aa4.15□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PRO1933Q9H354 126 aa4.15□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 C20orf202A1L168 122 aa4.14□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF56Q15929 161 aa4.13□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.13□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.13□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.13□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 K7EMI3 77 aa4.12□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 PET117Q6UWS5 81 aa4.12□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 C20orf78Q9BR46 151 aa4.12□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01546A6NGU7 62 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 H7C1H1 209 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 FCER1GP30273 86 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.1□□□□□ -1.75
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.1□□□□□ -1.75
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