RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PSENENQ9NZ42 101 aa-6.21□□□□□ -3.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TET3O43151 1660 aa-6.21□□□□□ -3.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-6.21□□□□□ -3.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ADGBQ8N7X0 1667 aa-6.22□□□□□ -3.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C3orf79P0CE67 100 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LINC00158P58513 81 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C1orf109Q9NX04 203 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-6.23□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HSD11B1P28845 292 aa-6.23□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PPP5D1E7EU14 171 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BANF1O75531 89 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM9BQ8IZU0 186 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MGST2Q99735 147 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 WIZO95785 1651 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HBDP02042 147 aa-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FABP2P12104 132 aa-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPCS3P61009 180 aa-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RGPD5Q99666 1765 aa-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCL8P80075 99 aa-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MMGT1Q8N4V1 131 aa-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DEPDC5O75140 1603 aa-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PIK3C2BO00750 1634 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SSNA1O43805 119 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OGNP20774 298 aaKnown RBP-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LINC01545Q5VT33 79 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAIMQ9NVQ4 179 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLB1Q6P1J6 1458 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 H0YIV9 168 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 H7C1C5 153 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 J3QLW9 94 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IGLC1P0CG04 106 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LCN6P62502 163 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BORCS7Q96B45 105 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PIK3C2GO75747 1445 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBE2G1P62253 170 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C10orf128Q5T292 105 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OTORQ9NRC9 128 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A6NIN4 97 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 F8WEM9 126 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PFDN6O15212 129 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IAPPP10997 89 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CRYGSP22914 178 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NUP188Q5SRE5 1749 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CHP2O43745 196 aa-6.31□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-6.31□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 V9GYQ6 96 aa-6.31□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DAPK1P53355 1430 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MYOM1P52179 1685 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 H3BQV1 296 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RTL8BQ17RB0 113 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RTL8AQ9BWD3 113 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A0A1B0GUL6 1792 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HMGN4O00479 90 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PDE6DO43924 150 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GALP22466 123 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RPS12P25398 132 aaKnown RBP-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TCL1AP56279 114 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TNNC1P63316 161 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BORCS8Q96FH0 119 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KDM5CP41229 1560 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CEP152O94986 1710 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CENPFP49454 3210 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LYNX1G3V0Z9 82 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM128Q5BJH2 165 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IQCF5A8MTL0 148 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UQCRQO14949 82 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SDC2P34741 201 aa-6.37□□□□□ -3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms