RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 C7orf33Q8WU49 177 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV4-1P06312 121 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 PMAIP1Q13794 54 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 WISP2O76076 250 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 INAFM1C9JVW0 142 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 H0Y9J4 135 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 DCANP1Q8TF63 244 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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PTPRD-201ENST00000355233 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZTC4 211 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.51□□□□□ -1.85
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