RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635519.1

NRXN1-242, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-242ENST00000635519 TSHBP01222 138 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 Q8IYB0 196 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF580Q9UK33 172 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 A6NN06 94 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 C19orf84I3L1E1 186 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 ZNHIT1O43257 154 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TRGV3P03979 118 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 THAP8Q8NA92 274 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 CCL17Q92583 94 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 Q9H8V8 135 aa4.12□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 NDUFC1O43677 76 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 PATE4P0C8F1 98 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 Q6ZTC4 211 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 A0A0J9YXY3 114 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 C16orf90A8MZG2 172 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 KRTAP10-9P60411 292 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 C15orf32Q32M92 178 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 Q9HAA7 133 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 CUBNO60494 3623 aa4.11□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 C12orf77C9JDV5 145 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 COX7A2LO14548 114 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 SPINK14Q6IE38 97 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 UBE2L6O14933 153 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 LCA10Q71F78 164 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TFF1P04155 84 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 CNFNQ9BYD5 112 aa4.1□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.09□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 UBE2BP63146 152 aa4.09□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.09□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.09□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF826PQ6ZT77 177 aa4.09□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 DIRC1Q969H9 104 aa4.09□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 MED13LQ71F56 2210 aa4.09□□□□□ -1.75
NRXN1-242ENST00000635519 A0A1W2PNR3 127 aa4.09□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 LINC00313P59037 77 aa4.09□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 DEFB126Q9BYW3 111 aa4.09□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 ACANP16112 2415 aa4.09□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 ZANQ9Y493 2812 aa4.09□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 A0A0A0MQY5 61 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 Q8N6K4 173 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 LEPROTO15243 131 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 hDV103S1A0JD37 113 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 IGKV1-16P04430 117 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 GPHB5Q86YW7 130 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.08□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 BCE1O60756 84 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 LEAP2Q969E1 77 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 A0A0J9YX75 114 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 PRCDQ00LT1 54 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 C10orf128Q5T292 105 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 AKAP6Q13023 2319 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 RNF223E7ERA6 249 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 PSPNO60542 156 aa4.07□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 PINLYPA6NC86 204 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 NCR3O14931 201 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 MIAQ16674 131 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 LYRM9A8MSI8 78 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 IGKV3-11P04433 115 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF32P17041 273 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 FAM27BQ5VT28 67 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 Q5VV11 94 aa4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
NRXN1-242ENST00000635519 CD28P10747 220 aa4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms