RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 EDN2P20800 178 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 APOC4P55056 127 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 hADV29S1A0JD25 119 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 F8W735 103 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 SLPIP03973 132 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 DEFB135Q30KP9 77 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00643Q86TS7 51 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRT-210ENST00000617474 TSHBP01222 138 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CRYGDP07320 174 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 PTPRBP23467 1997 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CDH23Q9H251 3354 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 ZMAT4Q9H898 229 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 KLK12Q9UKR0 248 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 ADAMTS20P59510 1910 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 KLLNB2CW77 178 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 MRAPQ8TCY5 172 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SPANXCQ9NY87 97 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TRIOO75962 3097 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TMEM89A2RUT3 159 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SPATA25Q9BR10 227 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SPAG11BQ08648 103 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 ODF3Q96PU9 254 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 IGIPA6NJ69 53 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 PSMB8P28062 276 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 Q6ZSV7 163 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF580Q9UK33 172 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRT-210ENST00000617474 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 DCANP1Q8TF63 244 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC179H3BU77 68 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 NDUFA7O95182 113 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 J3KT08 172 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 NDUFA1O15239 70 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 UBE2D1P51668 147 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 PRO0255Q9UI72 69 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 A0A1W2PPR1 153 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 AVPP01185 164 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 C9orf85Q96MD7 179 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 C20orf197Q8N268 126 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 EPG5Q9HCE0 2579 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 UBE2BP63146 152 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 LST1O00453 97 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 H7C423 109 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 NREPQ16612 68 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-210ENST00000617474 TIRAPP58753 221 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 CDK2AP2O75956 126 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 MUC4Q99102 2169 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 Q6YL49 198 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 SCXQ7RTU7 201 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TRANK1O15050 2925 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 UQCRQO14949 82 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 DIRC1Q969H9 104 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV1-40P01703 118 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 J3QKU1 62 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.3□□□□□ -0.6
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