RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607707.1

SNORD11B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11B, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11B-201ENST00000607707 DOCK1Q14185 1865 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 Q8N8P6 123 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 DR1Q01658 176 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 COX17Q14061 63 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 Q6AWC8 147 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 LZICQ8WZA0 190 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 PATJQ8NI35 1801 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 PI4KAP42356 2102 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 TNFP01375 233 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 SMCO1Q147U7 214 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 DEFB123Q8N688 67 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 COPZ2Q9P299 210 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.85□□□□□ -2.54
SNORD11B-201ENST00000607707 F8VRH5 84 aa-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 UQCR11O14957 56 aa-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 SPTA1P02549 2419 aa-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.85□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 CEP152O94986 1710 aa-0.86□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 DOCK2Q92608 1830 aa-0.86□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.86□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.86□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.86□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 M0R2T5 61 aa-0.87□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 SPINK4O60575 86 aa-0.87□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 TPPP2P59282 170 aa-0.87□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.87□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 NF1P21359 2839 aa-0.87□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 APOC3P02656 99 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 TSLPQ969D9 159 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 MGST2Q99735 147 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.89□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.89□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 RERGLQ9H628 205 aa-0.89□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 SERP1Q9Y6X1 66 aa-0.89□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 CFTRP13569 1480 aa-0.89□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 HMGN4O00479 90 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 ARPC4P59998 168 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.9□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.91□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.91□□□□□ -2.55
SNORD11B-201ENST00000607707 SFT2D2O95562 160 aa-0.91□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 SPRR2AP35326 72 aa-0.91□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.91□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.91□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 HERC2O95714 4834 aa-0.91□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 SPANXDQ9BXN6 97 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 PSME4Q14997 1843 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 TGP01266 2768 aa-0.92□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.93□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.93□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.93□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.93□□□□□ -2.56
SNORD11B-201ENST00000607707 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.93□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.5 ms