RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 HLA-DQA1P01909 254 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 APOC3P02656 99 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 PPBPP02775 128 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 S100PP25815 95 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 ORMDL3Q8N138 153 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM101Q96IK0 257 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 KIR2DL4Q99706 377 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 GCSHP23434 173 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP10-1P60331 282 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L23D6RBM5 183 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 PHOX2AO14813 284 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB5AP20339 215 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 RHEBQ15382 184 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM18Q96B42 140 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS47A8MTI9 375 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SNAPINO95295 136 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS1P07477 247 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01620Q4KN68 170 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SS18Q15532 418 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 C14orf177Q52M58 125 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SVBPQ8N300 66 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8N8P6 123 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CCL25O15444 150 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK2AP2O75956 126 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 XCL1P47992 114 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 COX19Q49B96 90 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 hDV102S1A0JD36 115 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM229AH3BQW9 127 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 XGP55808 180 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 HAMPP81172 84 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXI1Q12951 378 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP161Q6P656 301 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZUT4 128 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MT-ND6P03923 174 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 C5orf38Q86SI9 138 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM104AQ969W3 186 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SCO1O75880 301 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SLPIP03973 132 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MALP21145 153 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 C15orf56Q8N910 161 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 DPH3Q96FX2 82 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.1 ms