RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531257.1

FOXRED1-211, Transcript of FAD dependent oxidoreductase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXRED1, Length 800 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1-211ENST00000531257 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 HIGD1CA8MV81 97 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 TSHBP01222 138 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 SS18Q15532 418 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 AKAP14Q86UN6 197 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 A0A1B0GUT8 65 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 ESDP10768 282 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 CT83Q5H943 113 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 AMN1Q8IY45 258 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 ZNF727A8MUV8 499 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 RAB4AP20338 218 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 LINC01551Q86U37 167 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 TSKUQ8WUA8 353 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 CARD19Q96LW7 228 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.16□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 SMKR1H3BMG3 65 aa7.16□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 FCER1GP30273 86 aa7.16□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.16□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.16□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.16□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.15□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.15□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.15□□□□□ -1.26
FOXRED1-211ENST00000531257 MALP21145 153 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 SYCNQ0VAF6 134 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 RIGQ13278 110 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 FAM210AQ96ND0 272 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 OSTCQ9NRP0 149 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 TNXBP22105 4242 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 VCYO14598 125 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 CAMPP49913 170 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 GAGE2BQ13066 116 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 NUP35Q8NFH5 326 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 V9GYV3 84 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 COX7A2LO14548 114 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 PPP1R17O96001 155 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 ISOC2Q96AB3 205 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 LINC01600Q96MT4 127 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 KIR2DL4Q99706 377 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 PTTG1IPP53801 180 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 ODF1Q14990 250 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 ADIRFQ15847 76 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 NRACQ8N912 160 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.11□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 PPP1R2P9O14990 202 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 REG3GQ6UW15 175 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 Q6ZRP5 223 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 Q6ZUT4 128 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 C5orf38Q86SI9 138 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 TMEM18Q96B42 140 aa7.1□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
FOXRED1-211ENST00000531257 A0A0J9YXV3 536 aa7.08□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 APOMO95445 188 aa7.08□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 CKS2P33552 79 aa7.08□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.08□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.08□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 A0A1W2PNN7 141 aa7.07□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 SPAG11BQ08648 103 aa7.07□□□□□ -1.28
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FOXRED1-211ENST00000531257 NAT8Q9UHE5 227 aa7.07□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.06□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 LINC00862A6NCI5 91 aa7.06□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 C20orf78Q9BR46 151 aa7.06□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.06□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 C9JQL5 133 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 D6R8Y8 96 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 TNFRSF6BO95407 300 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 MT-ND6P03923 174 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 C2orf48Q96LS8 159 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.04□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 A0A1B0GW15 77 aa7.04□□□□□ -1.28
FOXRED1-211ENST00000531257 F8W036 122 aa7.04□□□□□ -1.28
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