RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	PRORY	Q9H606	182 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ATXN3-212	ENST00000515746	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ATXN3-212	ENST00000515746	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	FLNC	Q14315	2725 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	KNCN	A6PVL3	124 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		A8MZ25	164 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	RS1	O15537	224 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE7	O76087	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS2	P07478	247 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE12F	P0CL80	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE4	Q13068	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZSV7	163 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC2B	Q92478	149 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A096LNT2	108 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	FSHB	P01225	129 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	C22orf24	Q9Y442	160 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SPG11	Q96JI7	2443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		B4DSR2	109 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	COX7A2L	O14548	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	COX6C	P09669	75 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	COX6A2	Q02221	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF415	Q09FC8	603 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL19	Q99731	98 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		F5H768	121 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		J3QLI3	93 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAC	P01848	142 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	PRM2	P04554	102 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	ACYP1	P07311	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	GNLY	P22749	145 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5J2	P56134	94 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB131A	P59861	70 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8N2B8	174 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DAND5	Q8N907	189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DUX3	Q96PT4	197 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01587	Q99440	93 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DSCR9	P59020	149 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	NPC2	P61916	151 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	HERVK_113	P63121	156 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	LY6D	Q14210	128 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IMUP	Q9GZP8	106 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746		Q9H8V8	135 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	ZAN	Q9Y493	2812 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	INS	P01308	110 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84

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