RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 DCDP81605 110 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 UQCR10Q9UDW1 63 aa0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 FRAS1Q86XX4 4008 aa0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.2□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC37A2A6NM11 1700 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 MYOM1P52179 1685 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SFT2D2O95562 160 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 Q5BKY6 102 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 FAM213BQ8TBF2 198 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 CNFNQ9BYD5 112 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 MANBALQ9NQG1 85 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 PSME4Q14997 1843 aa0.19□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 FAM208BQ5VWN6 2430 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 F8P00451 2351 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 LRP6O75581 1613 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 TRAV22A0A0B4J277 110 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 NAP1L6A6NFF2 107 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 H3BQ15 152 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 BCE1O60756 84 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SPINK1P00995 79 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 S100A3P33764 101 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SNCAP37840 140 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 HSD52Q0P140 79 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 Q6JHZ5 121 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 PRO0255Q9UI72 69 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGEF5Q12774 1597 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 TET3O43151 1660 aa0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 WNK3Q9BYP7 1800 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 KDM3BQ7LBC6 1761 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM262E9PQX1 116 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 MGPP08493 103 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 IGLC1P0CG04 106 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 Q0VG73 95 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ERCC6L2Q5T890 1561 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 C14orf144Q96I85 54 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 CGREF1Q99674 301 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SBF2Q86WG5 1849 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 TCHHQ07283 1943 aa0.17□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 LAMC1P11047 1609 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SHANK2Q9UPX8 1470 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 PLXNB2O15031 1838 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM218A2RU14 115 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 COX6CP09669 75 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 KRTDAPP60985 99 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 UBE2D3P61077 147 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 UBE2D2P62837 147 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 SFTA2Q6UW10 78 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 FAM223AQ8IWN6 122 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 C12orf57Q99622 126 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 FAIMQ9NVQ4 179 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 PRO1854Q9UHT4 67 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 HMGXB3Q12766 1538 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa0.16□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.15□□□□□ -2.38
UBE2B-202ENST00000499038 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 M0R3E3 92 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 TRAPPC2P0DI81 140 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 TRAPPC2BP0DI82 140 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 Q8IZM0 81 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 IGF2RP11717 2491 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 TOP2BQ02880 1626 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 CACNA1CQ13936 2221 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0.15□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 SPTBN2O15020 2390 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 ABCC5O15440 1437 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 hADV29S1A0JD25 119 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 C10orf142B7Z368 130 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 RBP2P50120 134 aa0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
UBE2B-202ENST00000499038 SEC11AP67812 179 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms