RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493277.5

ZNF655-222, Transcript of zinc finger protein 655, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF655, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF655-222	ENST00000493277	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	APCS	P02743	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	PDE6D	O43924	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF655-222	ENST00000493277	XCL1	P47992	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277		A0A096LNI7	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	NCR2	O95944	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	FGF6	P10767	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	PMCH	P20382	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	CTRL	P40313	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	LRP2	P98164	4655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277		H7C423	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	CCL25	O15444	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	BCL2	P10415	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	TNXB	P22105	4242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277		I3L3M4	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	SS18	Q15532	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277		A0A0J9YXV3	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277		Q6ZRP5	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277		K7EN84	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	CEBPG	P53567	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277		A8MWL6	223 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	CAMP	P49913	170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ZNF655-222	ENST00000493277	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	TSHB	P01222	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	MT-ND6	P03923	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	FCER1G	P30273	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	COX7A2L	O14548	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	ESD	P10768	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277		A0A1B0GUT8	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277		A0A1W2PNN7	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	VCY	O14598	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	APOM	O95445	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZNF655-222	ENST00000493277	RAB4A	P20338	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms