RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZTI0 123 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 IL17DQ8TAD2 202 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 NPC2P61916 151 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 TEN1Q86WV5 123 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 SPANXCQ9NY87 97 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 MIAQ16674 131 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 K7EQD1 137 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 LINC00694P0DN24 101 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 C9JAW5 83 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 COX6A2Q02221 97 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 PPDPFLQ8WWR9 84 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 TIRAPP58753 221 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 LINC01006Q8NI28 216 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 TMEM101Q96IK0 257 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 CARD19Q96LW7 228 aa14.66□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A20O43772 301 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.65□□□□□ -0.06
IMP4-208ENST00000460766 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.65□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GAGE12JA6NER3 117 aa14.65□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 NDUFA7O95182 113 aa14.65□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GAGE4Q13068 117 aa14.65□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GAGE5Q13069 117 aa14.65□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 DAND5Q8N907 189 aa14.64□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 TRIAP1O43715 76 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 HERVK_113P63121 156 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 ATXN8Q156A1 80 aa14.62□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.61□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 NDUFA1O15239 70 aa14.61□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 SCGB1A1P11684 91 aa14.61□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 CDIP1Q9H305 208 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 TIMM17BO60830 172 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GAGE7O76087 117 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GAGE12FP0CL80 117 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GAGE12GP0CL81 117 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 GAGE12IP0CL82 117 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.6□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.59□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 Q9H8V8 135 aa14.59□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IMP4-208ENST00000460766 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 LINC01620Q4KN68 170 aa14.58□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 C16orf74Q96GX8 76 aa14.58□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.58□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.58□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 C16orf95Q9H693 158 aa14.58□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 IFITM1P13164 125 aa14.57□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 TENM4Q6N022 2769 aa14.57□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 A0A0U1RRA0 63 aa14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 UBE2L6O14933 153 aa14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 IGLV1-51P01701 117 aa14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 JMJD1CQ15652 2540 aa14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.55□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 COX6CP09669 75 aa14.55□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 RNF183Q96D59 192 aa14.55□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 M0QXV9 152 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 TMEM243Q9BU79 118 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G2AP14555 144 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 ACANP16112 2415 aa14.53□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.52□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.52□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
IMP4-208ENST00000460766 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.52□□□□□ -0.09
IMP4-208ENST00000460766 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms