RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAJINQ3KP22 176 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF727A8MUV8 499 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHOX2AO14813 284 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL25O15444 150 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSTCQ9NRP0 149 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB4AP20338 218 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT1HL1P0DM35 61 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SS18Q15532 418 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMN1Q8IY45 258 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STPG4Q8N801 248 aa16.5■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRP19P09132 144 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.49■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A096LNI7 61 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C7orf77A4D0Y5 90 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.48■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIGQ13278 110 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00526Q96FQ7 95 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKIGQ9Y2B9 76 aa16.47■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD164L2Q6UWJ8 174 aa16.46■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 V9GYV3 84 aa16.46■□□□□ 0.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMKR1H3BMG3 65 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCYO14598 125 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCER1GP30273 86 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP35Q8NFH5 326 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD19Q96LW7 228 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00474Q9P2X8 69 aa16.45■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBR4Q5T4S7 5183 aa16.44■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa16.43■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R17O96001 155 aa16.43■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR3P79522 188 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM241Q24JQ0 296 aa16.42■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISOC2Q96AB3 205 aa16.42■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYCNQ0VAF6 134 aa16.41■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.41■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRACQ8N912 160 aa16.41■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAT8BQ9UHF3 227 aa16.41■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.4■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.39■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIR2DL4Q99706 377 aa16.39■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MALP21145 153 aa16.38■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL23P62829 140 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa16.38■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R2P9O14990 202 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMPP49913 170 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADIRFQ15847 76 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX7A2LO14548 114 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAT8Q9UHE5 227 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNXBP22105 4242 aa16.33■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM18Q96B42 140 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMM21Q9BVV7 248 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GW15 77 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00862A6NCI5 91 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9JQL5 133 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTTG1IPP53801 180 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZUT4 128 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01600Q96MT4 127 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C20orf78Q9BR46 151 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CKS2P33552 79 aa16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE2BQ13066 116 aa16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMK2N2Q96S95 79 aa16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C5orf38Q86SI9 138 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEA15Q15121 130 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPINK6Q6UWN8 80 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZRP5 223 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf48Q96LS8 159 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCAPO15273 167 aa16.27■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOMO95445 188 aa16.27■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF6BO95407 300 aa16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REG3GQ6UW15 175 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GVG6 124 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S100A8P05109 93 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F8W036 122 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPAG11BQ08648 103 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMDT1Q9H4I9 107 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0J9YXV3 536 aa16.22■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PNN7 141 aa16.22■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 D6R8Y8 96 aa16.22■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HBBP68871 147 aa16.22■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.21■□□□□ 0.19
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