RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738		C9JQL5	133 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CHTF8	P0CG12	524 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	RIG	Q13278	110 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WYN8	130 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	MT1HL1	P0DM35	61 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NRAC	Q8N912	160 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	VCY	O14598	125 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL25	O15444	150 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R17	O96001	155 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	XCL1	P47992	114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	COX6A2	Q02221	97 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ADIRF	Q15847	76 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	LRP2	P98164	4655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PEA15	Q15121	130 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SS18	Q15532	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZRU5	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TNXB	P22105	4242 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00862	A6NCI5	91 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	DPH3	Q96FX2	82 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GW15	77 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	FCER1G	P30273	86 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	IFITM2	Q01629	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMP	P49913	170 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A096LNI7	61 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GXF2	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PHOX2A	O14813	284 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CARD19	Q96LW7	228 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CKS2	P33552	79 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	STPG4	Q8N801	248 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF213	Q63HN8	5207 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	HBB	P68871	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZUT4	128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf33	Q8WU49	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	TCAP	O15273	167 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	SYCN	Q0VAF6	134 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM18	Q96B42	140 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738		D6R8Y8	96 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	COX7A2L	O14548	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A8	P05109	93 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738		F8W036	122 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	NPY	P01303	97 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	PPBP	P02775	128 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	MAL	P21145	153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB14	P61106	215 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	C2orf48	Q96LS8	159 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.04	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms