RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB106AQ8N104 65 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 LENEPQ9Y5L5 61 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH6P13533 1939 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 AIPO00170 330 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE6DO43924 150 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANXA8P13928 327 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDKN2CP42773 168 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC11AP67812 179 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 C5orf38Q86SI9 138 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM223AQ8IWN6 122 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRO3102Q9H379 93 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP5D1E7EU14 171 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 F8VZ95 297 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BQV1 296 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHP2O43745 196 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFA3O95167 84 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIX6O95475 246 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 HBDP02042 147 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCALDP61601 193 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMED2Q15363 201 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-3.66□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH8P13535 1937 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM107AO95990 144 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PET100P0DJ07 73 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTL8BQ17RB0 113 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM78Q5T7P6 136 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCN9Q8WX39 176 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTL8AQ9BWD3 113 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTORQ9NRC9 128 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRYLO94915 3013 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLC7A0M8Q6 106 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSD11B1P28845 292 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNNC1P63316 161 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPATCH11Q8N954 259 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 C4AP0C0L4 1744 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 C4BP0C0L5 1744 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 EP400Q96L91 3159 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-3.68□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 CUX1P39880 1505 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NIN4 97 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCTN3O75935 186 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNNC2P02585 160 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 STAG3L3P0CL85 134 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL2P13500 99 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALP22466 123 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYGSP22914 178 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRO1933Q9H354 126 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3C2GO75747 1445 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GU69 56 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM213A2RRL7 107 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 IQCF5A8MTL0 148 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFT2D2O95562 160 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOEP02649 317 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100A6P06703 90 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNCAP37840 140 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL8P80075 99 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH2Q9UKX2 1941 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTAF1O14981 1849 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOCK2Q92608 1830 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BMG7 143 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3QLW9 94 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7EP13 123 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLVRAP53004 296 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEBPGP53567 150 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2G1P62253 170 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01545Q5VT33 79 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 MUC3AQ02505 3323 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN11AQ9UI33 1791 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PBRM1Q86U86 1689 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCNTO95613 3336 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCRQO14949 82 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-3.72□□□□□ -3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.6 ms