RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 APOC4P55056 127 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CSTL1Q9H114 145 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PKD1P98161 4303 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-53P01767 116 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 HTN1P15515 57 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RRN3P1Q2M238 152 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SPATA45Q537H7 98 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.63□□□□□ -1.67
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CCL20-202ENST00000409189 TIMM17AQ99595 171 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 JPT2Q9H910 190 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 I3L3M4 83 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 AZU1P20160 251 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 C18orf15Q96N68 181 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.62□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 AGRNO00468 2067 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GUV1 79 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LINC00587B1AMM8 73 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 K7EQD1 137 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PLNP26678 52 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZN92 141 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ERASQ7Z444 233 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TMEM141Q96I45 108 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PRO1933Q9H354 126 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.61□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GVY2 172 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 F8VRH5 84 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 H0Y8G0 127 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TSHBP01222 138 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGLC3P0DOY3 106 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP10-5P60370 271 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZTI0 123 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 ATOH7Q8N100 152 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.6□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WX48 190 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 GAGE10A6NGK3 116 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LYRM9A8MSI8 78 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A8MZ25 164 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 DPM2O94777 84 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IGKCP01834 107 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PRSS1P07477 247 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MIFP14174 115 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CRYBA4P53673 196 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 BAALCQ8WXS3 180 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RNF183Q96D59 192 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.59□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 MYCBP2O75592 4640 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.58□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 IGIPA6NJ69 53 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 PRM2P04554 102 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 COTL1Q14019 142 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 RETNQ9HD89 108 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.58□□□□□ -1.68
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