RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402583.5

CBX1-203, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene CBX1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-203ENST00000402583 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-203ENST00000402583 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-203ENST00000402583 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-203ENST00000402583 TMEM243Q9BU79 118 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-203ENST00000402583 Q9UF83 564 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-203ENST00000402583 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-203ENST00000402583 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-203ENST00000402583 PTPN13Q12923 2485 aa6.65□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 APCP25054 2843 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 A0A0B4J2C4 111 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.64□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 J3QR89 54 aa6.64□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 TSPAN13O95857 204 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 SMR3AQ99954 134 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 VPS25Q9BRG1 176 aa6.64□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 SPANXCQ9NY87 97 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 SPINK8P0C7L1 97 aa6.63□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 CFC1P0CG37 223 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 IFITM1P13164 125 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 CENPEQ02224 2701 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.63□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 ZFHX3Q15911 3703 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 A4D1N5 150 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 H3BMG7 143 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 NDUFA1O15239 70 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 KRTAP10-3P60369 221 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 RNF183Q96D59 192 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 ERG28Q9UKR5 140 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 ITPR3Q14573 2671 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 G3V4G9 280 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 PSMB2P49721 201 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 MIAQ16674 131 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.61□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 ZANQ9Y493 2812 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.6□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 CRLF1O75462 422 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 PRSS2P07478 247 aa6.6□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 AGRNO00468 2067 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 TENM4Q6N022 2769 aa6.59□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 IGHV3-33P01772 117 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 APOC4P55056 127 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 HERV-K104P63124 156 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 Q1RN00 199 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1-203ENST00000402583 LITAFQ99732 161 aa6.59□□□□□ -1.35
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CBX1-203ENST00000402583 LYRM9A8MSI8 78 aa6.58□□□□□ -1.36
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CBX1-203ENST00000402583 WFDC2Q14508 124 aa6.58□□□□□ -1.36
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CBX1-203ENST00000402583 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 PRO0461Q9UI25 63 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 COX6CP09669 75 aa6.57□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 DEFB130BP0DP73 79 aa6.57□□□□□ -1.36
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CBX1-203ENST00000402583 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.56□□□□□ -1.36
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CBX1-203ENST00000402583 GAGE6Q13070 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 ATXN8Q156A1 80 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.56□□□□□ -1.36
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CBX1-203ENST00000402583 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 Q9H8V8 135 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 PRO0255Q9UI72 69 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 X6R8D5 127 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-203ENST00000402583 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.55□□□□□ -1.36
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