RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 CDC42EP2O14613 210 aa2.81□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 C2orf82Q6UX34 121 aa2.81□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.81□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.81□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 DPH3Q96FX2 82 aa2.81□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 ITPR3Q14573 2671 aa2.81□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 MTORP42345 2549 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 M0R2P5 195 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP10-10P60014 251 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 PROK2Q9HC23 129 aa2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 CCDC168Q8NDH2 2452 aa2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 TRAV17A0A0B4J275 112 aa2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 PYYP10082 97 aa2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 TFF3Q07654 80 aa2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 COA5Q86WW8 74 aa2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.79□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 RBP4P02753 201 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 ESPL1Q14674 2120 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 SAR1AQ9NR31 198 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 CCDC167Q9P0B6 97 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 CACNA1CQ13936 2221 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.78□□□□□ -1.96
MDM2-201ENST00000258148 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 IGKV4-1P06312 121 aa2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 CASC2Q6XLA1 102 aa2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 COMMD6Q7Z4G1 85 aa2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 ATOH7Q8N100 152 aa2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 F8P00451 2351 aa2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 NAV3Q8IVL0 2385 aa2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.77□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 EDF1O60869 148 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 SLC48A1Q6P1K1 146 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 C4orf33Q8N1A6 199 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 LINC00052Q96N35 136 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 C12orf57Q99622 126 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 SCN3BQ9NY72 215 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 GNG8Q9UK08 70 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 MED12Q93074 2177 aa2.76□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 IFITM5A6NNB3 132 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 F6UZH7 168 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 YPEL1O60688 119 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 MIC13Q5XKP0 118 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 TEX261Q6UWH6 196 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 Q6ZUT4 128 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.75□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 CORTO00230 105 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP5-9P26371 169 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 CCDC179H3BU77 68 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 UQCRHP07919 91 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 FGF7P21781 194 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 REG4Q9BYZ8 158 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 SPG11Q96JI7 2443 aa2.74□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC13O75165 2243 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 ACANP16112 2415 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 MPDZO75970 2070 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 BBIP1A8MTZ0 92 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 J3QRE1 110 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 HYPMO75409 117 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 IFI6P09912 130 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 MYO7BQ6PIF6 2116 aa2.73□□□□□ -1.97
MDM2-201ENST00000258148 SNX29P2Q8IUI4 249 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms