RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 LGALS9O00182 355 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 IGKCP01834 107 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 H3BMM0 161 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 CEND1Q8N111 149 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 DSCR8Q96T75 97 aa7.31□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 LINC00315P59091 139 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 OXTP01178 125 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 C2orf48Q96LS8 159 aa7.3□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 HIGD1BQ9P298 99 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.29□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.29□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 HIST1H4GQ99525 98 aa7.29□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.28□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.27□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.27□□□□□ -1.24
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USP11-201ENST00000218348 C16orf95Q9H693 158 aa7.27□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.27□□□□□ -1.24
USP11-201ENST00000218348 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 Q5XG85 94 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 Q6ZSN1 163 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 PRO0628Q9UI54 55 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 RETNQ9HD89 108 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 LINC01549A6NIU2 74 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 hADV29S1A0JD25 119 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 M0QY20 66 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 MALP21145 153 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 VCYO14598 125 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 MED14OSP0DP75 135 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 H7C1H1 209 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 F8VRH5 84 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 TSHBP01222 138 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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USP11-201ENST00000218348 TCL1BO95988 128 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 LINC01546A6NGU7 62 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 C11orf86A6NJI1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 Q6Q795 121 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 DPH3Q96FX2 82 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 C1orf195Q5TG92 126 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 INSP01308 110 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 ZMAT4Q9H898 229 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 STAB1Q9NY15 2570 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 HERVK_113P61574 105 aa7.21□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.21□□□□□ -1.25
USP11-201ENST00000218348 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.21□□□□□ -1.26
USP11-201ENST00000218348 PF4P02776 101 aa7.21□□□□□ -1.26
USP11-201ENST00000218348 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.21□□□□□ -1.26
USP11-201ENST00000218348 Q6ZTI0 123 aa7.21□□□□□ -1.26
USP11-201ENST00000218348 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.21□□□□□ -1.26
USP11-201ENST00000218348 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.21□□□□□ -1.26
USP11-201ENST00000218348 M0R2P5 195 aa7.21□□□□□ -1.26
USP11-201ENST00000218348 PPP1R17O96001 155 aa7.21□□□□□ -1.26
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