RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	GTR1	Q00582	310 aa		3.6	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	SSP2	Q08646	371 aa		3.6	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	LAM4	P38800	1345 aa		3.6	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	MTF2	P10849	440 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	YCL049C	P25577	312 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	XRS2	P33301	854 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	ELF1	P36053	145 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	PSY4	P38193	441 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	YJL193W	P39542	402 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	POL31	P46957	487 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	IML2	P47031	731 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	SNF12	P53628	566 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	MRPL13	Q02204	264 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	ENT2	Q05785	613 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	RKI1	Q12189	258 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VMA10	YHR039C-A	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	PCK1	P10963	549 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	CLB4	P24871	460 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	PPZ2	P33329	710 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	YMC2	P38087	329 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	YBR138C	P38277	524 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	YEL025C	P39991	1188 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	YEL020C	P39994	560 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	BNA1	P47096	177 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	IMA1	P53051	589 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	TRS31	Q03337	283 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	UFO1	Q04511	668 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	TFC6	Q06339	672 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	SSM4	P40318	1319 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	SEC12	P11655	471 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	BIK1	P11709	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RIT1	P23796	513 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ADY2	P25613	283 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	MRPL7	P36519	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	STB5	P38699	743 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	PPE1	P38796	400 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	MIT1	P40002	666 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	VFA1	P40080	203 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	BNR1	P40450	1375 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	SMK1	P41808	388 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	COS12	P53053	380 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RPN13	O13563	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	NUC1	P08466	329 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	DSS4	P32601	143 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RRN3	P36070	627 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	FLO10	P36170	1169 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	NPR3	P38742	1146 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	CAB2	P40506	365 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	PMT6	P42934	759 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ARO10	Q06408	635 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	OPY2	Q06810	360 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	AIM6	Q07716	390 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ICL2	Q12031	575 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	STE12	P13574	688 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	STE4	P18851	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	SPO11	P23179	398 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	MCM10	P32354	571 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	IFA38	P38286	347 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	MUP3	P38734	546 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RAD26	P40352	1085 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	PSF2	P40359	213 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	BST1	P43571	1029 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	MEP3	P53390	489 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	GIS1	Q03833	894 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	VPS64	Q03944	604 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ARA2	Q04212	335 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	HOF1	Q05080	669 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	BET2	P20133	325 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	VPS34	P22543	875 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	RER1	P25560	188 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	PEX2	P32800	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	CTF18	P49956	741 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	USA1	Q03714	838 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	TRM8	Q12009	286 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VMA10	YHR039C-A	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.2 ms