RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W PCK1P10963 549 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W BIK1P11709 440 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W HMG2P12684 1045 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.42□□□□□ -1.86not detected
RTT105YER104W ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RIT1P23796 513 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PGS1P25578 521 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PRE4P30657 266 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YKL050CP35736 922 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RPP1P38786 293 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YEL068CP39977 110 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W IRC6P43615 237 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W BIT61P47041 543 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TAH11P47112 604 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MDR1P53258 950 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MRPL19P53875 158 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TDA9Q04545 1251 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YCG1Q06680 1035 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W FRE5Q08908 694 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TRM8Q12009 286 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ADE3P07245 946 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MET8P15807 274 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ARG1P22768 420 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W KIN82P25341 720 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SWI3P32591 825 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CNS1P33313 385 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SET3P36124 751 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W UBS1P38290 277 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YHR112CP38716 378 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ELO3P40319 345 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CAB2P40506 365 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W GSM1P42950 618 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W BST1P43571 1029 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YAP1802P53309 568 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YKU80Q04437 629 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YLR287CQ05881 355 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W VPS36Q06696 566 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W GRC3Q07845 632 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TAH18Q12181 623 aa3.41□□□□□ -1.86
RTT105YER104W OPI1P21957 404 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SAC6P32599 642 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TOA1P32773 286 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W NPL6P32832 435 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PEX5P35056 612 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YNL195CP40168 261 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W KHA1P40309 873 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W FKH2P41813 862 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TEL2P53038 688 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RSC1P53236 928 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W COX18P53239 316 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ATG21Q02887 496 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W NRG1Q03125 231 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SNO4Q04902 237 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W HSP32Q08992 237 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W NBP2Q12163 236 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ZRT2Q12436 422 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W POM34Q12445 299 aa3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RTT105YER104W HSP82P02829 709 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TPK1P06244 397 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W FUR1P18562 216 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PXA2P34230 853 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PPS1P38148 807 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YHL017WP38745 532 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W VFA1P40080 203 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W AMA1P50082 593 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W MRPS35P53292 345 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W BSC5P53755 489 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TIM10P87108 93 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ACS1Q01574 713 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W FCP1Q03254 732 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W VPS64Q03944 604 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TAF11Q04226 346 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ADY4Q05955 493 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YLR352WQ06479 807 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W AIM41Q12032 185 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TGL5Q12043 749 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SKM1Q12469 655 aa3.39□□□□□ -1.87
RTT105YER104W HOM3P10869 527 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W OLE1P21147 510 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SEC15P22224 910 aa3.38□□□□□ -1.87
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