RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 TET3O43151 1660 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CUTAO60888 179 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 TCHPQ9BT92 498 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF202O95125 648 aa23.37■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 H0YIN7 160 aa23.36■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 FGAP02671 866 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.36■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 PDE8BO95263 885 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF445P59923 1031 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF5AQ12840 1032 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE8P0CG41 777 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 SH2D4AQ9H788 454 aa23.35■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 KRT83P78385 493 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 RASEFQ8IZ41 740 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.35■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.34■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 PHACTR2O75167 634 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 TACC1O75410 805 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 TCP10Q12799 353 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 PKP1Q13835 747 aa23.34■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 NEK11Q8NG66 645 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.34■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2IP78347 998 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 SP4Q02446 784 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNDQ07001 517 aa23.33■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE4DQ08499 809 aa23.33■■□□□ 1.32
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PTPRJ-208ENST00000615445 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
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PTPRJ-208ENST00000615445 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CBX8Q9HC52 389 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 NF2P35240 595 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAF5O00463 557 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.322e-8■■■■■ 28.9
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PTPRJ-208ENST00000615445 HOOK3Q86VS8 718 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBB4AP04350 444 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE9A4FU28 777 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CNGA4Q8IV77 575 aa23.31■■□□□ 1.32
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